Патрушев Максим Владимирович

 

Фамилия Имя Отчество:

Патрушев Максим Владимирович

Место работы (учебы):

НИЦ «Курчатовский институт»

Должность (курс обучения):

Зам. рук. КК НБИКС-природоподобных технологий

Название доклада:

Конструирование генетических сетей

Анонс:

Конструирование генетических сетей — комплексное направление синтетической биологии (СБ), которое находится на начальных стадиях своего развития. Сегодня мы лишь формулируем общие концепции направления, создаем основу для формирования СБ как инженерной дисциплины. Конечная цель   -научиться конструировать заданные свойства живых организмов прибегая к стандартному набору инструментов.
Рассматривая клетку как дискретную или аналоговую систему, опираюсь на язык электросхемотехники в целом и булеву логику как логическую операционную единицу в частности, мы научились создавать сложнейшие устройства внутри клеток. Были созданы различные поведенческие паттерны, управляемые как внешними стимулами, так и под контролем внутренних регуляторов; устройства кратковременной и долговременной клеточной памяти; системы вычислений; различные многоуровневые сенсоры и т.д.
Несмотря на достигнутые результаты, конструирование искусственных генетических сетей все еще остается сложно задачей, успех которой зависит от большого числа факторов, прежде всего от функциональной независимости сетей от естественного окружения их в клетке. Вследствие этого много внимания уделяется созданию ортогональных систем, характеризующихся отсутствием взаимодействия с компонентами клеток.
Общим результатом является создание библиотек частей (parts) и устройств (device), с описанием характеристик их взаимодействия с другими частями и устройствами. Используя части или устройства из библиотек в определенном типе клеток можно быть уверенным в том, что они будут функционировать заданным образом. Комбинируя такие части и устройства мы можем создавать системы сетей в клетке, которая по сути определит ее новый общий фенотип. Иначе говоря, таким образом мы можем создать совершенно новую клетку, часть функций у которой будет не свойственна ее естественному предшественнику.

Биография:

Кандидат биологических наук, заместитель руководителя Курчатовского комплекса НБИКС-природоподобных технологий.
Закончил аспирантуру и защитил диссертацию в ИТЭБ РАН (г. Пущино). Руководил лабораторией геномных и протеомных исследований БФУ им. И. Канта (г. Калининград). Работал директором института живых систем БФУ им. И.Канта