Кузнецов Дмитрий Юрьевич

 

Фамилия Имя Отчество:

Кузнецов Дмитрий Юрьевич

Место работы (учебы):

ООО «СкайДжин»

Должность (курс обучения):

Ведущий специалист отдела научной поддержки

Название доклада:

10X Genomics — уникальная технология анализа транскриптомов единичных клеток

Анонс:

Инфильтрующие лимфоциты играют важную роль в биологии опухолей, антигены опухолей активируют иммунные клетки. Параллельно с этим процессом клетки опухоли адаптируются к воздействию иммунной системы организма. Исследования и скрининги клеток иммунной системы в опухолевых образцах направлены на поиск и активацию механизмов иммунитета, подавляющих развитие опухолей.
Изучение межклеточных взаимодействий лимфоцитов и опухолевых клеток на молекулярном уровне позволяет идентифицировать мишени для иммунотерапии. В последствии обнаруженные закономерности могут быть положены в основу разработки новых методов терапии онкологических заболеваний.
10x Genomics предлагает решение для поиска и определения адаптивного иммунного ответа в опухолевых образцах. Технология профилирования иммунных клеток основана на анализе комбинаций V(D)J-регионов Т- и B-клеток. Исследование полноразмерных транскриптов антигенных рецепторов десятков тысяч отдельных лимфоцитов сочетает в себе анализ V(D)J-регионов, а также полноценный анализ 5’-экспрессии генов. Такое решение позволяет идентифицировать разнообразие, клональность и фенотип инфильтрующих Т- и/или B-клеток отдельно от общего пула данных. Компания 10x Genomics предоставляет решение для иммунологического профилирования десятков тысяч Т- или B-клеток. Суспензия клеток, меченых антителами или MHC-пептидами, помещается на чип и процессируется в приборе. На выходе получаются баркодированные транскрипты, причем для иммунологического профилирования кДНК подвергается направленному обогащению транскриптами Т- или В-клеточных рецепторов до подготовки библиотеки. После секвенирования баркоды используются для группировки транскриптов, принадлежащих одной клетке, что позволяет определить транскриптом и полноразмерные последовательности рецепторов единичных Т- или В-клеток. Полученные последовательности также используют для идентификации определенного антигена каждой отдельно взятой клетки, что позволяет более точно изучать особенности врождённого и адаптивного иммунитета.

Биография:

В 2012 году окончил Естественно-географический факультет Башкирского государственного педагогического университета им. М. Акмуллы по специальности «Генетика». С 2013 по 2016 год учился в аспирантуре Института биохимии и генетики УНЦ РАН. С 2015 по 2018 год являлся научным сотрудником Башкирского государственного университета.